INTI Microbiología es una red de laboratorios microbiológicos, que forman parte de los diferentes Centros del INTI distribuidos por todo el país, unificados por una Dirección que programa, coordina y supervisa tareas de Investigación y Desarrollo en esta especialidad. El INTI no podía permanecer ajeno a las nuevas actividades tecnológicas que, mediante el manejo de microorganismos, está cambiando la relación del ser humano con la salud, la producción y el ambiente y en este sentido las tareas de investigación y desarrollo programadas por INTI Microbiología se proyectan a las tecnologías de producción de alimentos y fármacos, seguridad alimentaria, sanidad en términos poblacionales, cuidado del ambiente, productos biobasados, energía renovable, biodigestión, biorefinerías, biotransfomaciones y biosíntesis, tratamiento de aguas, intervención en los grandes ciclos naturales, modificaciones virtuosas del ecosistema, sin dejar de lado sus proyecciones biotecnológicas, electrónicas, nanotecnológicas e informáticas.